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基于SSR标记的云南35个玉米自交系遗传多样性分析

李松, 施德林, 董云武, 杨亚丽, 余娇娇

李松, 施德林, 董云武, 等. 基于SSR标记的云南35个玉米自交系遗传多样性分析[J]. 云南农业大学学报(自然科学), 2023, 38(5): 732−738. DOI: 10.12101/j.issn.1004-390X(n).202202041
引用本文: 李松, 施德林, 董云武, 等. 基于SSR标记的云南35个玉米自交系遗传多样性分析[J]. 云南农业大学学报(自然科学), 2023, 38(5): 732−738. DOI: 10.12101/j.issn.1004-390X(n).202202041
LI Song, SHI Delin, DONG Yunwu, et al. Analysis of Genetic Diversity of 35 Maize Inbred Lines in Yunnan Based on SSR Markers[J]. JOURNAL OF YUNNAN AGRICULTURAL UNIVERSITY(Natural Science), 2023, 38(5): 732-738. DOI: 10.12101/j.issn.1004-390X(n).202202041
Citation: LI Song, SHI Delin, DONG Yunwu, et al. Analysis of Genetic Diversity of 35 Maize Inbred Lines in Yunnan Based on SSR Markers[J]. JOURNAL OF YUNNAN AGRICULTURAL UNIVERSITY(Natural Science), 2023, 38(5): 732-738. DOI: 10.12101/j.issn.1004-390X(n).202202041

基于SSR标记的云南35个玉米自交系遗传多样性分析

基金项目: 国家自然科学基金项目(32160741);云南省地方本科高校青年项目(2017FH001-099);云南省地方本科高校联合面上项目(2018FH001-041)。
详细信息
    作者简介:

    李松(1986—),男,云南玉溪人,硕士,讲师,主要从事植物分子标记技术育种研究。E-mail:lis007@yxnu.edu.cn

    通信作者:

    余娇娇(1983—),女,云南保山人,博士,讲师,主要从事玉米营养生理与遗传研究。E-mail:jiaojiaoyu@yxnu.edu.cn

  • 中图分类号: S513.032

摘要:
目的 

合理利用国内外玉米种质资源进行玉米品种改良。

方法 

利用农业标准(NY/T 1432—2014)推荐的简单重复序列标记(simple sequence repeat,SSR)核心引物,以云南玉溪培育的35个稳定玉米自交系为研究材料进行遗传多样性分析。

结果 

共有20对引物在品种间存在105个多态性片段,每对引物扩增出3~9个多态性片段,平均每个引物5.25个;Nei’s遗传多样性指数为0.134~0.365,平均为0.240;Shannon’s信息指数为0.247~0.538,平均为0.385;SSR多态信息量平均值为0.644,变幅为0.482~0.832。聚类分析结果显示:遗传相似系数平均为0.704,变幅为0.505~0.962;在遗传相似系数0.650处可将35个品种聚为4大类群。

结论 

35个玉米自交系遗传多样性丰富,含有杂种优势。研究结果可为云南玉溪玉米品种的选育和推广提供理论依据及实践指导。

 

Analysis of Genetic Diversity of 35 Maize Inbred Lines in Yunnan Based on SSR Markers

Abstract:
Purpose 

To make rational use of maize germplasm resources to improve maize varieties.

Method 

The genetic diversity of 35 maize inbred lines, which cultivated in Yuxi City, were carried out based on simple sequence repeat (SSR) primers recommended by agricultural industry standard (NY/T 1432—2014).

Results 

A total of 20 pairs of SSR primers presented polymorphic among 35 varieties, and 105 alleles were detected. The number of alleles detected by each pair of primers was 3 to 9, with an average of 5.25. The Nei’s genetic diversity index was 0.134 to 0.365, with an average of 0.240. The Shannon’s information index was 0.247 to 0.538, with an average of 0.385. The polymorphism information content of SSR distribution ranges from 0.482 to 0.832, with an average of 0.644. The cluster analysis showed the genetic similarity coefficient ranged from 0.505 to 0.962, with an average of 0.704, and when the genetic similarity coefficient was 0.650, 35 varieties were divided into four groups.

Conclusion 

The genetic diversity of 35 maize inbred lines in Yunnan is abundant, including multiple heterosis groups. The results of this study can provide theoretical basis and practical guidance for breeding and promotion of Yuxi maize varieties in Yunnan Province.

 

  • 据统计,中国约有65%的人口都以稻米为主食,而且水稻播种面积常年居于3000万hm2上下,稻谷年产量达2.1亿t以上[1-2]。在中国许多地区,水稻高温热害已经成为影响水稻生长发育的主要自然灾害之一,尤其是在长江流域以及南方稻区[3]。近年来,为保证国家粮食安全,“籼改粳”已经成为中国南方稻区的重要任务之一[4],因此在南方稻区进行粳稻品种的选育工作具有更为重要的现实意义。

    粳稻和籼稻的耐高温特性存在一定的差异,且一般情况下,籼稻的耐高温性普遍强于粳稻,这可能是由于高温主要影响籼稻当天开放的颖花;而粳稻则不同,高温除了影响当天开放的颖花外,对次日开放的颖花也有不利的影响[5]。李守华等[6]研究发现:最近50年江汉平原的平均气温和最高气温并未升高,整体保持基本稳定,长期温度变化表现出一定的周期特征,即7—8月期间,连续3和5 d平均气温高于30 ℃以及最高温度高于35 ℃的天气出现频次高,且有增加趋势,这对水稻花期可能产生致命性伤害。对高温最敏感的时期为水稻减数分裂期和开花期,这2个时期遭遇高温对水稻结实率的影响最大,因此,通常在这2个时期进行耐高温品种的鉴定筛选[7-8]。此外,水稻开花期如遭遇35 ℃以上的高温,会造成颖花不育和结实率下降,最终使产量降低[9-10]

    有研究发现:高温胁迫后,水稻叶片的质膜通透性增强,游离脯氨酸增多,但是过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)和超氧化物歧化酶(SOD)活性均呈上升趋势[11]。郭培国等[12]通过对水稻进行夜间高温胁迫后发现:水稻叶片光合速率降低并且出现了氧化症状,随着高温胁迫时间增加植株体内的O2−和H2O2含量也增高,但POD、CAT和SOD活性随着时间先升高而后降低,这说明随着高温胁迫时间延长,活性氧的生成速度已经远远大于活性氧的清除速度,并且长时间高温会抑制抗氧化酶活性,使植株受到过氧化损伤。

    以往关于水稻耐高温特性的筛选鉴定多是利用间接鉴定法,即利用人工气候箱等设备对水稻的温度、光照和湿度等自然要素进行严格控制,但是这类方法的鉴定结果往往会与大田实际生产结果有较大的出入。本试验基于大田自然条件,与盆栽温室控温相结合,以使各品种水稻自始穗期起经历至少连续7 d日均温度高于32 ℃或最高温度高于35 ℃的高温胁迫,通过对水稻总粒数、结实率、千粒质量和抗氧化酶活性等指标进行测定,综合各项指标对15个粳稻品种的耐高温特性进行评价,筛选出具有耐高温特性且产量因子表现好的优质品种,以期为粳稻耐高温品种鉴定筛选研究提供新思路,为耐高温粳稻种质资源的利用提供参考依据,也为耐高温粳稻品种的培育提供基础材料,保证水稻的稳产和高产。

    试验于2017—2019年在华中农业大学作物遗传与改良国家重点实验室盆栽场进行。试验田前茬为冬闲田,土壤类型为黄棕壤水稻土,试验前测得大田表层0~20 cm土壤基础养分为:有机质18.89 g/kg,速效钾145.32 mg/kg,速效磷9.52 mg/kg,碱解氮 65.11 g/kg,pH 6.08。试验前测得盆栽土壤基础养分为:有机质46.55 g/kg,速效钾188.46 mg/kg,速效磷16.81 mg/kg,碱解氮143.65 mg/kg,pH 5.35。

    试验以中日韩15份粳稻品种为材料:W1202(中国山东)、奥羽392 (日本)、丰优100 (中国吉林)、合系27号 (中国云南)、垦育16号 (中国河北)、辽粳326 (中国辽宁)、临稻16号 (中国山东)、龙粳25号 (中国吉林)、牡丹江17 (中国黑龙江)、千重浪1号 (中国辽宁)、青旱稻(中国山东)、沈农2100 (中国辽宁)、万年(中国辽宁)、永山稻(韩国)和元子粘稻(中国江苏)。依次编号为S1~S15,均由中国农业科学院作物科学研究所提供。

    2017—2019年,大田试验为每年每份材料种植1个小区,规格为(4×5)株,行株距为16 cm×16 cm,小区之间间距均为32 cm。高温处理采用自然高温胁迫的方式[11-12],自始穗期起经历至少连续7 d日均温度高于32 ℃或最高温度高于35 ℃的品种才视做经历了高温胁迫,调整播期使抽穗开花期集中在7月中下旬和8月中上旬。大田试验基肥施用复合肥30 kg/667 m2,在一叶一心期和分蘖期分别追施尿素5 kg/667 m2。试验期间适时进行人工除草和防治病虫害。

    2019年进行盆栽试验。盆钵规格为下部直径16 cm,上部直径19.5 cm,盆高19 cm。每份材料单插本,10次重复,每2个重复排成1列,每列盆钵连续排列,行间距为90 cm。水稻见穗初期将4株移入温室进行为期7 d的高温处理(日最高温度 > 35 ℃),作为高温胁迫组;6株采用遮阳降温(日最高温度<35 ℃且日平均温度<32 ℃),作为对照组。土壤氮磷钾有效含量分别为0.15、0.10和0.15 g/kg;追肥为每升水溶解尿素2.7 g、磷酸二氢钾1.6 g和氯化钾1.1 g,于分蘖期和孕穗期追施。试验期间适时进行人工除草和防治病虫害。

    试验期间,利用美国生产的HOBO自动温湿度记录仪每30 min自动记录1次大田自然温度。

    在水稻成熟期,选取3株具有代表性、长势较好且接近的水稻,晒干后脱粒,利用全自动数字化考种机[13]对总粒数、实粒数、结实率和千粒质量等指标进行测定,并计算盆栽试验的相对结实率。

    相对结实率=试验组结实率/对照组结实率×100%。

    根据NY/T 2915—2016《水稻高温热害与鉴定标准》对水稻的耐热等级进行评价分级。(1) 强耐热型:相对结实率≥95%;(2) 耐热型:75%≤相对结实率<95%;(3) 中间型:55%≤相对结实率<75%;(4) 不耐热型:35%≤相对结实率<55%;(5) 极不耐热型:相对结实率<35%。

    高温处理结束后,分别选取对照组和试验组3株长势较好且一致的水稻,每株水稻取剑叶1~2 g,利用酶试剂盒测定水稻剑叶的超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)活性。测试盒分别为:A001-1 (羟胺法,南京建成科技有限公司)、A084-3 (南京建成科技有限公司)和A007-1 (可见光法,南京建成科技有限公司)。试验过程严格按照试剂盒说明书操作。

    考种数据及采集温度数据利用Excel 2010进行计算和整理,使用SPSS 21.0统计分析软件对产量性状及抗氧化酶活性进行方差分析。

    图1可知:2017年温度波动较大,2019年相对2018年极端高温天气出现的更加频繁。

    图  1  2017—2019 年抽穗开花期的日均温度和最高温度
    Figure  1.  Daily average temperature and maximum temperature during heading and flowering period from 2017 to 2019

    表1可知:各品种大田试验始穗期开始,2017年只有S1和S7未经历连续至少7 d平均温度高于 32 ℃或最高温度高于35 ℃的高温胁迫;2018和2019年的温度波动起伏相对较小,平均温度主要维持在32 ℃以上,平均最高温度主要在37 ℃左右波动,2019年平均最高温度比2018年略有升高,即在年度大田重复试验中各品种至少经历了2次高温胁迫。

    表  1  各粳稻品种始穗期及连续7 d平均温度和平均最高温度
    Table  1.  Japonica rice varieties average temperature and average maximum temperature in initial heading stage during 7 days
    品种编号
    variety No.
    始穗期
    initial heading stage
    7 d 平均温度/℃
    7 d average temperature
    7 d 平均最高温度/℃
    7 d average maximum temperature
    201720182019201720182019201720182019
    S108-0607-2107-3129.9332.4932.5934.3037.1338.07
    S207-2407-1908-1033.1532.7131.4738.7837.1036.79
    S307-1507-1907-3132.0832.7132.5937.5237.1038.07
    S407-2607-2907-2831.5131.4333.1136.8735.7038.00
    S507-2707-1908-0930.4432.7131.5835.5337.1036.79
    S607-2307-2408-0133.8232.8132.5939.7137.4837.85
    S707-2907-2408-0229.5532.8132.4234.5437.4637.87
    S807-2208-0907-2334.0432.0333.2539.9436.7237.38
    S907-1407-2308-0231.9832.7532.4237.2937.4437.87
    S1007-2007-1907-2733.4932.7133.3638.9437.1038.02
    S1107-2607-2707-2231.5132.1933.0836.8736.7437.30
    S1207-2307-2407-2833.8232.8133.1139.7137.4838.00
    S1307-2407-1908-0133.1532.7132.5938.7837.1037.85
    S1407-2507-2307-3032.5632.7532.6338.0537.4437.95
    S1507-1407-1907-2831.9832.7133.1137.2937.1038.00
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    表2可知:2017—2019年,S2和S4的单株总粒数均高于2 000,S3和S15的单株实粒数均低于1000,S2、S5、S7、S8、S9、S10和S11千粒质量均高于20 g,S1、S2和S14的结实率均达80%以上,S3结实率均低于50%。

    表  2  2017—2019年各粳稻品种产量因子
    Table  2.  Yield factor of japonica rice varieties from 2017 to 2019
    品种编号
    variety No.
    年均单株总粒数
    annual average total grain
    number per plant
    年均单株实粒数
    annual average real grain
    number per plant
    年均千粒质量/g
    annual average 1 000-
    grain weight
    年均结实率/%
    annual average seed
    setting rate
    201720182019201720182019201720182019201720182019
    S116621469230814071354196519.5426.7525.2984.6692.1885.07
    S220142252317917701832265321.6623.3625.8587.8881.3283.42
    S3171220631515 648 791 60425.3116.4520.4337.8538.4746.82
    S421622183225015721938192818.1129.4128.8072.7189.1285.67
    S521611481252315501437190125.2821.2723.5971.7397.1775.38
    S6102023511986 7531882157819.8025.7923.3473.8280.0681.26
    S7112121392001 8672003174227.2824.9526.5677.3893.6087.04
    S818021613146512901400108421.6224.8522.3471.5886.7973.95
    S9 89814931655 5411227134125.3225.0423.2360.2481.9780.79
    S10210117201805 6871118106521.6322.9921.3832.7064.9958.48
    S11 36515502534 3151460142322.7622.9221.1786.3094.6055.95
    S12183116921165 6181451 91617.6123.7623.0033.7587.8279.10
    S1314982012148212101775 91617.3828.0124.2280.7789.3061.86
    S1415322116129812641899103913.3627.0825.7982.5189.7480.05
    S1513621623 675 463 669 3578.0124.3925.3133.9941.0852.87
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    由于S1和S7在2017年未经历连续至少7 d日均温度高于32 ℃或最高温度高35 ℃的高温胁迫,故S1和S7的年均结实率以2018和2019年的结实率进行统计。由图2可知:在高温胁迫下,各粳稻品种产量构成因子稳定性存在差异。S1、S2、S4、S5、S7和S14的年均结实率均高于80%,S6、S8、S11和S13的年均结实率在75%~80%,S3、S9、S10、S12和S15的年均结实率均低于75%,S3年均结实率最小,且S3、S10和S15的年均结实率显著低于除S9和S12以外的其他品种(P<0.05)。

    图  2  高温胁迫对不同粳稻品种年均结实率的影响
    注:不同小写字母表示不同品种或处理间差异显著(P<0.05);下同。
    Figure  2.  Effect of high temperature stress on the annual average seed setting rates of different japonica rice varieties
    Note: Different lowercase letters indicate significant differences in different varieties or treatments (P<0.05); the same as below.

    以15个粳稻品种相对结实率进行耐热等级评价分级(图3)可知:S2、S7、S8和S9是强耐热型品种,S1、S4、S5、S6、S11、S12、S13和S14是耐热型品种,S3、S10和S15是中间型品种。筛选出的强耐热品种和耐热品种均是研究粳稻耐热生理机制的良好材料。

    图  3  抽穗开花期不同温度对不同品种结实率的影响
    Figure  3.  Influence of temperature during the flowering stage on the seed setting rates of different varieties

    图4可知:不同品种间的SOD、CAT和POD 活性均有所差异,且各品种在经历了高温胁迫后的抗氧化酶活性均高于对照组,说明高温胁迫会使植株体内SOD、CAT和POD 活性增高。高温胁迫下,强耐热型品种S7、S8和S9的SOD活性均高于200 U/mg,且3个品种的SOD和POD 活性均显著高于对照组(P<0.05),但S2的3种抗氧化酶活性均显著高于对照组(P<0.05);耐热型品种中,除S4的POD活性外,其他品种高温胁迫组与对照组的SOD、CAT和POD活性差异均达显著水平(P<0.05);中间型品种中,高温胁迫组的SOD和CAT活性与对照组差异均不显著(P>0.05),且仅S3的高温胁迫组与对照组POD活性差异达显著水平(P<0.05)。

    图  4  高温胁迫下不同品种的抗氧化酶活性
    Figure  4.  Antioxidant enzyme activities of different varieties under high temperature stress

    表3可知:高温胁迫组SOD、CAT和POD 活性互为极显著正相关,说明在高温胁迫下不同粳稻品种3种抗氧化酶活性协同增长,结实率与SOD、CAT和POD 活性均未达到显著相关水平。对照组中,CAT活性与POD 活性极显著相关,说明在非高温胁迫下,CAT和POD活性协同增长,结实率与SOD、CAT和POD活性均未达到显著相关水平。

    表  3  水稻结实率与抗氧化酶活性的相关分析
    Table  3.  Correlation analysis of seed setting rate and antioxidant enzyme activity
    指标
    index
    高温胁迫组 high temperature stress group对照组 control group
    SODCATPOD相对结实率
    relative seed setting rate
    SODCATPOD相对结实率
    relative seed setting rate
    SOD1.0000.750**0.709**0.3321.0000.4450.287−0.253
    CAT0.750**1.0000.807**0.4950.4451.0000.722**0.261
    POD0.709**0.807**1.0000.4570.2870.722**1.0000.205
    注:“**”表示达到 0.01 显著性水平。
    Note: “**” represents 0.01 significance.
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    水稻耐热性鉴定是水稻耐热种质资源评价和利用的基础,耐热性鉴定方法的科学性是准确评价及利用耐热种质资源的关键。高温胁迫会对水稻的表型指标及生理生化指标产生不同程度的影响。姚凤梅等[14]以开花期日最高温度>35 ℃、灌浆期日最高温度>32 ℃为高温指标;陈升孛等[15]以日最高气温大于35 ℃且持续3 d或以上作为水稻出现高温热害的指标。本研究在前人研究的基础上,延长高温胁迫时间,以在抽穗开花期进行至少连续7 d日均温度>32 ℃或最高温度>35 ℃为标准,研究高温胁迫对粳稻结实率的影响。

    本研究表明:丰优100 (S3)、千重浪1号(S10)和元子粘稻(S15)经历高温后结实率低,对高温的耐受性较低,是中间型品种;奥羽 392 (S2)、临稻16号(S7)、龙粳25号(S8)和牡丹江17 (S9)是强耐热型品种;W1202 (S1)、合系27号(S4)、垦育16号(S5)、辽粳326 (S6)、青旱稻(S11)、沈农2100 (S12)、万年(S13)和永山稻(S14)是耐热型品种。其中,奥羽392 (S2)、合系27号(S4)和垦育16号(S5)的年均结实率均>80%,千粒质量和单株总粒数保持相对较高的水平,临稻16号(S7)的结实率>85%,且年均千粒质量最大。综上所述,奥羽392 (S2)和临稻16号(S7)是具有强耐高温能力且综合农艺性状较好的品种,这些材料对未来粳稻耐高温遗传研究及育种工作意义重大。

    在正常条件下,水稻体内自由基的生成和清除处于动态平衡,当处于高温逆境下,水稻体内的这种平衡会被打破从而导致活性氧的积累,最终伤害细胞。黄英金等[16]研究发现:高温胁迫后,水稻叶片的质膜通透性增强,游离脯氨酸增多,过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)和超氧化物歧化酶(SOD)活性均呈上升趋势,说明这几类酶活性增强是水稻遭遇高温后的保护机制之一。张桂莲等[17]研究发现:水稻叶片中含有POD、CAT和SOD,这3种酶活性在高温胁迫初期有所上升,之后迅速降低,且耐高温能力强的水稻酶活增幅较大。本研究表明:经历了连续高温胁迫后,15份材料的SOD、CAT和POD活性均不同程度升高,这与前人研究结果一致。其中,丰优100 (S3)、千重浪1号(S10)和元子粘稻(S15)的结实率经高温胁迫后降幅较大,同时SOD、CAT和POD活性在高温条件下与对照组差异不明显,结实率降低的原因可能就是抗氧化酶系统中的SOD、CAT和POD活性对高温胁迫的抗逆响应不灵敏。高温胁迫下,耐热型品种和强耐热型品种W1202 (S1)、垦育 16 号(S5)、辽粳326 (S6)、青旱稻(S11)、沈农2100 (S12)、万年(S13)、永山稻(S14)、临稻16号(S7)、龙粳25号(S8)和牡丹江17 (S9)的SOD、CAT和POD活性高于对照组,说明高温环境下抗氧化酶活性升高有利于抵御高温胁迫产生的危害[18]。另外,临稻16号、龙粳25号和牡丹江17等3份耐热材料在遭遇高温后CAT活性变化不明显,说明植株体内H2O2的清除可能不仅仅依靠CAT,还存在着其他清除机制[19];耐热型材料合系27号的POD活性升高不显著,这可能是由于POD本身在酶保护系统中就存在着双面性,可能在逆境中促进了活性氧的生成以及叶绿素的降解,从而导致细胞膜脂过氧化,伤害植株[20]

    本研究还发现:经历高温胁迫后,水稻植株体内的SOD、CAT和POD活性存在协同增长,但均未与结实率达显著相关,说明抗氧化酶升高会防止植株损伤,是活性氧清除机制的组成部分之一,但并不是全部[18],其完整的保护机制仍有待进一步深入研究。盆栽试验中抗氧化酶(SOD、POD和CAT)活性变化趋势与结实率评价耐高温特性的结果几乎吻合,并且与田间高温试验的结果比较一致,进一步说明遭遇高温胁迫后水稻剑叶抗氧化酶活性与水稻的结实率呈正相关关系。

    综上所述,依据相对结实率对水稻的耐高温特性进行分级评价是可靠的,这适用于大批量水稻的鉴定筛选。

    本研究依据相对结实率筛选出2个综合农艺性状较好且具有强耐高温特性的优异品种;此外,可结合表型和生理生化等多项指标,尤其是水稻剑叶中的抗氧化酶活性进行综合考察和评价,最终确定水稻的耐高温特性。

  • 图  1   引物P06对35份玉米自交系扩增的SSR电泳带型

    Figure  1.   Electronic bands amplified by SSR primer P06 for 35 maize inbred lines

    图  2   35个玉米自交系的聚类分析

    Figure  2.   Clustering analysis of 35 maize inbred lines

    表  1   35个自交系编号及来源

    Table  1   Codes and origin of 35 maize inbred lines

    序号
    No.
    自交系编号
    code of inbred lines
    来源
    origin
    序号
    No.
    自交系编号
    code of inbred lines
    来源
    origin
    1 1 金峰1号 Jinfeng No. 1 19 33-1 XFB-1
    2 2 YGA-1 20 34 郑单958 Zhengdan 958
    3 3 金峰1号 Jinfeng No. 1 21 35 XFB-1
    4 5 东单 Dongdan 22 40 郑单958 Zhengdan 958
    5 7 冀丰58 Yifeng 58 23 41-2 素湾 Suwan
    6 7-1 先玉 Xianyu 24 45A 郑单958 Zhengdan 958
    7 7-1A 冀丰58 Yifeng 58 25 47 先玉 Xianyu
    8 7-2 冀丰58 Yifeng 58 26 DKM 迪卡007 Dika 007
    9 8 东单 Dongdan 27 DKF 迪卡007 Dika 007
    10 9 XFB-1 28 ZD19F 正大619 Zhengda 619
    11 10 XFB-1 29 CP888 正大 Zhengda
    12 12 先玉 Xianyu 30 XYMB16-R 先玉335 Xianyu 335
    13 14A XFB-1 31 XYMB16-W 先玉335 Xianyu 335
    14 15-1A 东单 Dongdan 32 YE1 XFB-1
    15 15-2 东单 Dongdan 33 YX001 金峰1号 Jinfeng No. 1
    16 24 郑单958 Zhengdan 958 34 YX002 素湾 Suwan
    17 29-1 YGA-1 35 YX003 XFB-1
    18 31-1 XFB-1
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    表  2   20对SSR核心引物的多态性评估

    Table  2   Polymorphism evaluation of 20 SSR core primers

    引物编号
    code of primer
    引物
    primer
    多态性片段
    polymorphic fragments
    Nei’s基因多样性指数
    Nei’s diversity index
    Shannon’s信息指数
    Shannon’s information index
    PIC值
    PIC value
    P01 bnlg439w1 4 0.240 0.382 0.568
    P02 umc1335y5 3 0.301 0.465 0.482
    P03 umc2007y4 5 0.194 0.356 0.721
    P04 bnlg1940k7 6 0.153 0.267 0.702
    P05 umc2105k3 9 0.284 0.449 0.832
    P06 phi053k2 4 0.261 0.428 0.502
    P07 phi072k4 4 0.237 0.386 0.516
    P08 bnlg2291k4 5 0.330 0.510 0.709
    P09 umc1705w1 8 0.215 0.356 0.756
    P10 bnlg2305k4 6 0.173 0.305 0.688
    P11 bnlg161k8 8 0.134 0.247 0.783
    P12 bnlg1702k1 9 0.287 0.444 0.812
    P13 umc1545y2 5 0.162 0.266 0.684
    P14 umc1125y3 3 0.222 0.356 0.522
    P15 bnlg240k1 5 0.365 0.538 0.675
    P16 phi080k15 4 0.237 0.372 0.556
    P17 phi065k9 3 0.321 0.491 0.503
    P18 umc1492y13 4 0.248 0.392 0.548
    P19 umc1432y6 5 0.249 0.393 0.643
    P20 umc1505k12 5 0.176 0.296 0.668
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    表  3   35个玉米自交系的DNA指纹图谱

    Table  3   DNA fingerprint of 35 maize inbred lines

    自交系编号
    code of inbred lines
    P01P02P03P04P05P06P07P08P09P10P11P12P13P14P15P16P17P18P19P20
    1 0001 010 00100 001000 000011001 0010 0001 00110 00010100 000010 00010000 010100100 00100 100 11010 0001 100 0010 00100 00100
    2 0001 001 00010 000100 000011001 0001 0001 00001 00000001 010000 00010000 000101001 00010 001 11010 0010 100 0001 00010 00100
    3 0001 100 00100 001000 000011001 0001 1000 00110 00010100 010000 00010000 010100100 00010 001 11010 0100 001 1100 00001 00100
    5 0100 000 00000 010000 000011001 0100 0100 00001 00011000 000100 00100000 000101001 00010 001 11010 0100 100 1000 00010 00100
    7 0001 011 00010 000100 000011001 0000 1000 11000 00000001 000001 00000100 110001000 00010 001 11010 0100 100 0100 00010 00000
    7-1 0101 010 01000 000100 001010100 1000 0010 11001 01010000 000010 00001001 000101001 00010 001 11010 0010 010 0010 00001 01010
    7-1A 0100 010 00010 000100 001011101 1000 1000 11001 00010100 000010 00001001 000101001 00111 001 11010 0110 010 0010 00001 00010
    7-2 0001 010 00100 000100 001010100 1001 1001 11000 00000001 000001 00000001 010010100 00110 001 11010 0100 010 1000 01100 00010
    8 0100 001 10000 000010 110001000 0100 1000 00001 01010000 010000 00000001 000101001 00110 001 11010 0100 010 1000 01100 00100
    9 0100 001 01000 001000 000011001 1001 0001 01100 00010100 100000 00001000 010100100 00110 011 11010 0001 101 1000 00110 00100
    10 1001 001 00010 001000 000110010 0010 0001 00001 00100110 100000 00001000 010101011 00000 001 11010 0100 101 0110 01100 00100
    12 0101 010 01100 000100 001010100 0001 1000 11000 01010000 000010 01000000 000101001 00100 010 11010 0100 100 0010 01100 00010
    14A 0100 010 00010 000010 110001000 1010 0001 11100 00000001 000001 00000001 010100100 00010 001 01111 0110 100 1000 01100 00100
    15-1A 0100 011 10000 000010 001010100 0100 0100 11000 00011001 000001 00100001 001101101 00010 001 11010 0100 011 1000 01100 00100
    15-2 0100 001 10000 010000 000110010 0100 0100 00001 00011000 000001 00100000 000101001 00010 001 11010 0100 010 1000 01100 00100
    24 0010 001 01000 000010 110001000 0100 1000 00001 01010000 010000 00000001 001000010 00010 001 11010 0001 001 0010 00000 00010
    29-1 0001 000 01000 000100 000011001 0001 0001 11000 01010000 010000 00010000 000101001 00010 010 11010 0010 100 0010 11000 10000
    31-1 0100 011 10000 001000 110001010 0110 0001 11001 00010101 000011 00001000 010101011 00010 001 01111 0100 101 1000 01100 00100
    33-1 0001 010 00010 000100 110001000 0010 0100 01100 00010101 000100 00100000 110001000 00010 001 11010 0110 100 0010 01100 00001
    34 0100 001 01000 000010 110001000 0100 1000 00001 00000110 010000 00000001 001010010 00100 001 11010 0001 001 0010 00000 00100
    35 0001 001 00100 001000 110001010 1001 0001 00001 00000110 001000 00100000 010100100 00010 001 00000 0100 100 0110 01100 00100
    40 0010 001 01000 000010 110001000 0100 1000 00001 10100000 010000 00000001 001010010 00100 001 11010 0010 001 0010 00000 00100
    41-2 1000 000 00100 000010 001010010 0010 0001 00110 00000110 001000 00001000 010100100 01000 001 10001 0100 100 0010 00010 00100
    45A 0010 001 01000 000010 110001000 1000 1000 00001 10100000 010000 00000001 001010010 00010 001 11010 0010 001 0010 00000 00100
    47 0101 000 01000 000100 000011001 0001 0001 11000 00000001 010000 00010001 000101001 00010 001 11010 0100 100 1010 11000 00010
    DKM 0100 100 01100 000010 110001010 0010 1000 00110 00000110 001000 01000000 010100100 10010 001 01101 0010 101 0100 00110 00100
    DKF 0100 010 00010 001000 000010010 0010 0100 11001 00000001 000010 10000000 011001000 00010 001 01101 0010 101 1100 01100 00010
    ZD19F 0100 011 00001 000100 000110010 0010 0010 00001 00000111 001010 00000001 001000000 00010 001 11010 0010 100 0010 00001 10000
    CP888 1000 000 00010 001000 000110010 0010 0100 11000 00000001 000010 10000000 010100100 00010 001 01101 0010 100 0100 01100 01000
    XYMB16-R 0100 011 00100 100000 000011001 1000 0001 00001 01010000 010000 00010000 000101001 00010 001 10010 0010 100 0010 01100 00000
    XYMB16-W 0100 011 00100 000100 000011001 1000 0001 00110 00010101 010000 00010000 000101001 00010 100 10010 0010 100 0010 01100 00000
    YE1 0001 110 00100 001000 000011000 0110 0101 00111 00010101 000010 00110000 010101101 00010 101 00011 1100 100 0010 01100 01010
    YX001 0100 010 00010 001000 000110010 0010 0100 11110 00000001 000011 10000000 010100100 00010 001 10010 0010 101 1000 01100 00010
    YX002 0001 100 01100 000001 000110000 0010 1000 00110 00000110 001000 00000010 010100100 00010 001 10001 0010 100 0100 00010 00100
    YX003 0001 001 00010 001000 110001000 1000 0001 00110 00010100 000110 00000100 000101001 10010 010 11010 0100 100 1000 01100 00010
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出版历程
  • 通信作者:  余娇娇 jiaojiaoyu@yxnu.edu.cn
  • 收稿日期:  2022-02-22
  • 修回日期:  2023-06-15
  • 网络首发日期:  2023-10-10

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