火烧和施肥对亚高山草甸植物多样性及生物量的影响
Effects of Fire and Fertilization on the Species Diversity and Biomass Accumulation of Subalpine Meadows
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Keywords:
- subalpine meadows /
- species diversity /
- aboveground biomass /
- grassland improvement
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NPR1 (nonexpresser of pathogenesis-related genes1)基因在植物的系统获得抗性(systemic acquired resistance,SAR)中起关键的作用[1]。SAR为存在于植物中、以病程相关蛋白(pathogenesis-related proteins,PR)表达为特征的广谱抗性,并需要水杨酸(salicylic acid, SA)信号转导的诱导[2]。CAO等[3]在1994年分离到1株缺乏水杨酸-2,6-二氯异烟肼(2,6-dichloroisonicotinic acid,INA)表达的拟南芥npr1突变株,该植株不能对各种SAR诱导物处理做出应答反应。随后NPR1得到了广泛深入的研究[4],并成为植物水杨酸介导的抗病信号转导通路的标志基因。因此,在涉及水杨酸信号转导途径的研究中,npr1是一个重要的实验材料。本研究对经EMS (ethylmethane sulfonate)诱变的拟南芥npr1-2突变体的纯合性进行了检测,然后利用qRT-PCR技术对NPR1基因表达水平进行测定,并用水杨酸敏感性试验加以验证,为进一步研究NPR1与其他基因的关系,以及为水杨酸信号途径的功能研究提供试验材料。
1. 材料与方法
1.1 植物材料和种植管理
野生型拟南芥(Arabidopsis thaliana)为Columbia (Col-0)生态型。npr1-2突变体购自美国Lehle seeds公司,为Col-0生态型背景。种子用次氯酸钠消毒液浸泡10~15 min进行表面消毒;灭菌水冲洗3~5次,确保冲洗干净。将种子点播在固体Murashige Skoog (MS)培养基上,培养皿用parafilm封口膜封口,置于4 ℃冰箱中2~3 d进行春化处理。然后移入12 h光照/12 h黑暗、22 ℃的光照培养箱中。培养1周后,将幼苗逐苗移栽到装有V(营养土):V(蛭石)为2:1的小盆中,浇适量水后盖上透明塑料薄膜并放入组培室中培养,3 d后揭去薄膜,在拟南芥的生长过程中注意定期浇水和除虫管理。用于水杨酸敏感性试验的拟南芥种子播于含有28 μmol/L水杨酸的MS培养基上,进行垂直培养,以便观察根的生长情况。组培室的条件为:光照强度约50 μmol/(m2·s),12 h光照/12 h黑暗,相对湿度60%~70%,温度22~23 ℃。
1.2 基因组 DNA 提取
按Edwards法提取[5]:从拟南芥植株上剪取叶子1~2 片,置于1.5 mL的离心管中研磨成匀浆。加入400 μL的Edwards提取液研磨后12 000 r/min离心。上清转移用异丙醇混匀,冰浴或−20 ℃放置5~10 min。12 000 r/min离心5 min,沉淀用70%的乙醇洗1次,在空气中干燥,溶于20~50 μL的灭菌水中,−20 ℃保存备用。
1.3 纯合突变体的鉴定
npr1-2为经化学诱变剂甲基磺酸乙酯(ethylmethane sulfonate,EMS)诱变的点突变体[3],在npr1-2的突变点附近,设计NPR1鉴定引物:5′-AGACTCTTGCCTCTTAGTGT-3′;5′-GAGCGAAACTATATGACGCC-3′。引物由上海捷瑞生物工程有限公司合成。进行PCR反应,琼脂糖凝胶电泳,DNA Marker为Biomed 公司的BM2000+。电泳后,将清晰明亮的条带切下,由上海life有限公司测序,将测序结果与网站序列进行比对。
1.4 荧光实时定量PCR
利用Trizol法提取拟南芥组织总RNA,用分光光度计(NanoDrop 2000 Thermo Scientific,USA)测定浓度及OD260/OD280比值,并用琼脂糖凝胶电泳检测RNA完整性。按照HiScript II Q RT SuperM.ix for qPCR (+gDNA wiper)(Vazyme,R223-01)说明操作,将待测RNA逆转录成cDNA。逆转录完毕后加入90 μL Nuclease-free H2O储存在−20 ℃冰箱备用。实时荧光定量RT-PCR测定利用QuantiFast® SYBR® Green PCR Kit试剂盒(Qiagen,Germany)在LightCycler® 480Ⅱ型荧光定量PCR仪(Roche,Swiss)上进行反应,以18 sRNA基因作为内参,每个样品做3次重复。
2. 结果与分析
2.1 突变位点和纯合性鉴定
npr1-2为EMS诱变碱基替换突变,在突变位置附近设计引物,npr1-2的两引物之间的长度为575 bp;试验提取了9个不同npr1-2突变体株系叶片的DNA,用所设引物进行PCR扩增,产物用琼脂糖凝胶电泳检测,结果得到了9条预期的扩增条带(图1)。切割条带,进行DNA碱基序列的测定(图2)。
将测序结果在TAIR网上与NPR1基因的序列进行对比,结果显示:npr1-2突变体的第152个碱基G突变成了A,即由野生型的半胱氨酸TGC突变为酪氨酸TAC,符合npr1-2所产生的点突变(图2)[1]。同时检测到npr1-2的杂合体和纯合体(图3),保存纯合的npr1-2。
2.2 纯合突变体npr1-2中NPR1基因的表达水平检测
通过利用荧光实时定量PCR对npr1-2纯合突变体植株中NPR1基因的表达量进行分析发现:突变体突变后,NPR1基因表达量明显下调(图4)。
2.3 突变体对水杨酸的敏感性试验
NPR1在植物系统获得性抗性诱导中发挥作用的分子机制目前比较清楚,NPR1蛋白被认为是水杨酸的受体,通过感受和调节水杨酸的信号转导来启动病程相关基因(PR)的转录[4, 6]。因此NPR1突变后,植株对水杨酸的敏感性降低。利用高浓度水杨酸会抑制拟南芥根生长的特性,本研究将拟南芥种子播种于含水杨酸的MS培养基上,观察拟南芥幼苗的根生长情况,以了解突变体对水杨酸的响应变化。将npr1-2纯合突变体和野生型种子播于含有28 μmol/L水杨酸的培养基上,20 d时观察到野生型幼苗生长受到严重抑制,而 npr1-2突变体幼苗的生长受抑程度显著低于野生型,即其根长明显长于野生型(图5,表1)。上述研究结果表明:npr1-2纯合突变体对水杨酸敏感性下降是由NPR1基因表达量下调引起的。
图 5 野生型与npr1-2根对水杨酸的敏感性试验(Bar=1 cm)注:a) 野生型幼苗在不含SA的培养基上根生长情况; b) npr1-2幼苗在不含SA的培养基上根生长情况;c) npr1-2幼苗在含28 μmol/L SA的培养基上根生长情况;d) 野生型幼苗在含28 μmol/L SA的培养基上根生长情况。Figure 5. Response of wild type and npr1-2 seedlings to salicylic acid treatmentNote: a) root growth of WT seedlings on medium without SA; b) root growth of npr1-2 seedlings on medium without SA; c) root growth of npr1-2 seedlings on medium containing 28 μmol/L SA; d) root growth of WT seedlings on medium containing 28 μmol/L SA.表 1 水杨酸处理后野生型与npr1-2突变体根生长长度Table 1. Length of roots in wild type and npr1-2 mutant plants treated with salicylic acid植物类型plant type 处理treatment 根长度/cm length of roots 野生型wild-type 未处理untreated 3.448±0.566 a npr1-2突变体mutant of npr1-2 未处理untreated 3.137±0.664 ab 野生型wild-type 水杨酸处理treated with salicylic acid 0.802±0.035 Ac npr1-2突变体mutant of npr1-2 水杨酸处理treated with salicylic acid 1.731±0.050 BC 注:同列中不同小写字母表示差异性达5%显著水平;不同大写字母表示差异性达1%极显著水平。
Note: Different lowercases within the same column indicate significant difference at 5% level; different capital letters within the same column indicate significant difference at 1% level.3. 讨论
通过试验得到了拟南芥水杨酸信号转导缺陷突变npr1-2纯合植株,以此为材料,进行了实时荧光定量RT-PCR以及水杨酸敏感性鉴定实验,结果显示:纯合突变体npr1-2中NPR1基因表达量明显下调,并且突变体幼苗对水杨酸的敏感性显著降低。NPR1蛋白含有2个保守的蛋白-蛋白互作结构域,即N末端的BTB/POZ和中部的锚蛋白重复结构域,npr1-2突变发生在锚蛋白重复结构域中,使半胱氨酸(150氨基酸残基)突变为酪氨酸(400氨基酸),导致无义密码子,产生丢失194个氨基酸C末端缺乏的水杨酸受体位点消失的截短蛋白[1]。CAO等[1]研究表明:npr1突变体具有对外施高浓度(5 mmol/L)水杨酸敏感的表型,认为是npr1突变体解毒功能下降所致,但没有呈现具体的实验结果。本研究将纯合的npr1-2突变体和野生型种子播种于含28 μmol/L 水杨酸的MS中,垂直培养20 d,发现水杨酸抑制了植物幼苗根的生长,但npr1-2幼苗根的受抑制程度明显低于野生型,我们推测npr1-2突变体对水杨酸感受的顿挫,导致其对较低浓度作为信号分子的水杨酸的敏感性降低。
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图 1 火烧和施肥对地上总生物量的影响
注:CK. 对照;F30. 施肥30 g;F60. 施肥60 g;B. 火烧;B+F30. 火烧+施肥30 g;B+F60. 火烧+施肥60 g;不同的小写字母表示处理间在P<0.05水平差异显著;下同。
Figure 1. Effects of burning and fertilization on the above-ground total biomass of subalpine meadow
Note: CK. control; F30. fertilization 30 g; F60. fertilization 60 g; B. burning; B+F30. burning + fertilization 30 g; B+F60. burning + fertilization 60 g; Different lowercase letters denote statistically significant differences between treatments (P<0.05), according to Student-Newman-keuls multiple range test; the same as below.
表 1 火烧和施肥下植物种类组成
Table 1 Botanic composition of subalpine meadow after burning and fertilization
序号No. 植物种名plant family 植物种名plant species 重要值importance value CK F30 F60 B B+F30 B+F60 1 菊科 Asteraceae 火绒草Leontopodium leontopodioides — 0.12 0.15 0.03 0.11 — 2 白莲蒿Artemisia stechmanniana 0.09 0.05 0.14 — — 0.29 3 绒背蓟Cirsium vlassonianum 0.11 — — — — — 4 兔耳一枝箭Piloselloides hirsute 0.16 0.14 0.15 — — — 5 紫菀Aster tataricus 0.09 0.04 — — — — 6 黄帚橐吾Ligularia virgaurea — — — 0.33 0.15 0.17 7 豆科 Fabaceae 红三叶Trifolium pratense 0.04 0.60 0.54 — 0.11 0.04 8 白三叶Trifolium repens 0.09 0.51 0.31 — 0.05 0.07 9 百脉根Lotus corniculatus — 0.08 0.10 0.21 0.18 0.10 10 山黧豆Lathyrus quinquenervius 0.01 — — — — — 11 禾本科 Poaceae 洽草Koeleria macrantha — 0.11 0.11 — 0.18 12 发草Deschampsia cespitosa — 0.03 0.01 — — — 13 披碱草Elymus dahuricus 0.13 0.19 0.22 — — — 14 草地早熟禾Poa pratensis 0.48 0.23 0.46 0.23 0.23 0.95 15 唇形科 Lamiaceae 风轮菜Clinopodium chinense 0.09 — — — — — 16 串铃草Phlomis mongolica — — — 0.42 0.47 0.29 17 夏枯草Prunella vulgaris — — — 0.01 — 0.01 18 蓼科 Polygonaceae 圆穗蓼Polygonum macrophyllum — — — 0.10 — — 19 珠牙蓼Polygonun viviparum — — — 0.09 — — 20 尼泊尔酸模Rumex nepalensis — — — 0.01 — — 21 灯心草科 Juncaceae 葱状灯心草Juncus allioides — — — 0.19 0.17 0.15 22 西藏地杨梅Luzula jilongensis 0.05 0.07 0.08 — — — 23 毛茛科 Ranunculaceae 小花草玉梅Anemone rivularis — 0.01 0.01 — — — 24 云生毛茛Ranunculus nephelogenes — — — 0.05 — — 25 蔷薇科 Rosaceae 西南委陵菜Potentilla lineata 0.59 0.25 0.45 0.11 0.08 0.13 26 萝藦科 Asclepiadaceae 大理白前Cynanchum forrestii 0.08 0.05 0.06 — 0.04 — 27 鸢尾科 Iridaceae 西南鸢尾Iris bulleyana 0.16 0.56 0.07 0.53 0.68 0.36 28 玄参科Scrophulariaceae 长花马先蒿Pedicularis longiflora — — — 0.17 0.14 0.16 29 大戟科Euphorbiaceae 大狼毒Euphorbia jolkinii 0.87 0.21 0.57 0.53 0.43 0.28 30 莎草科Cyperaceae 华扁穗草Blysmus sinocompressus — — — 0.01 — — 31 柳叶菜科 Onagraceae 柳叶菜Epilobium hirsutum — — — 0.01 — — 注:“—”. 物种未在样地出现;CK. 对照;F30. 施肥 30 g;F60. 施肥 60 g;B. 火烧;B+F30. 火烧+施肥 30 g;B+F60. 火烧+ 施肥 60 g;下同。
Note:“—”. species did not appear in the plots; CK. control; F30. fertilization 30 g; F60. fertilization 60 g; B. burning; B+F30. burning + fertilization 30 g; B+F60. burning + fertilization 60 g; the same as below.表 2 火烧和施肥对亚高山草甸群落相似性系数的影响
Table 2 Effects of burning and fertilization on the community similarity coefficient of subalpine meadow
% 项目
itemF30 F60 B B+F30 B+F60 CK 74.1 66.7 25.8 41.4 42.9 F30 76.9 40.0 57.1 66.7 F60 26.7 50.0 51.9 B 68.8 64.5 B+F30 89.7 -
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