云南农业大学学报(自然科学)
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云南农业大学学报(自然科学) 2017, Vol. 32 Issue (4) :571-576    DOI: 10.16211/j.issn.1004-390X(n).2017.04.001
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普通野生稻(Oryza rufupogon)糖基转移酶基因OrGT1(t)的克隆与表达分析
罗碧1,2, 冯洁深1,2, 白和灵1,2, 刘超1,2, 赵锦龙1,3, 谭亚玲1,2,4, 徐津1,2,4
1. 云南农业大学 农学与生物技术学院, 云南 昆明 650201;
2. 云南农业大学 稻作研究所, 云南 昆明 650201;
3. 大理州种子管理站, 云南 大理 671000;
4. 云南省杂交粳稻工程技术研究中心, 云南 昆明 650201
Cloning and Expression Analyses of Glycosyltransferases Gene OrGT1(t) in Oryza rufupogon
LUO Bi1,2, FENG Jieshen1,2, BAI Heling1,2, LIU Chao1,2, ZHAO Jinlong1,3, TAN Yaling1,2,4, XU Jin1,2,4
1. College of Agronomy and Biotechnology, Yunnan Agricultural University, Kunming 650201, China;
2. Rice Research Institute of Yunnan Agricultural University, Kunming 650201, China;
3. Dali Seed Administration Station, Dali 671000, China;
4. Yunnan Engineering Research Center for Japonica Hybrid Rice, Kunming 650201, China

摘要
参考文献
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摘要 [目的]对野生稻中木糖基转移酶基因开展初步研究,为进一步探索单子叶植物中木葡聚糖的合成及功能研究打下坚实的基础。[方法]利用同源克隆的方法,从普通野生稻(Oryza rufipogon)中克隆了1个糖基转移酶基因OrGT1。[结果]序列分析结果显示:该基因具有1个保守的Glyco-transf-34结构域,属于糖基转移酶34家族的基因。系统进化分析表明:该基因可能是1个木葡聚糖合成中的木糖转移酶基因。实时荧光定量分析表明:该基因在普通野生稻的在根、茎、叶和穗中均有表达,但在不同组织中表达有明显差异,其中茎的表达量最高,而根中的表达量最低。[结论]OrGT1基因在进化过程中高度的功能保守性,推测OrGT1t)基因可能是1个参与木葡聚糖合成的木糖基转移酶基因,该研究结果为进一步探索该基因的功能打下良好的基础。
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罗碧
冯洁深
白和灵
刘超
赵锦龙
谭亚玲
徐津
关键词普通野生稻   糖基转移酶基因   基因克隆   实时荧光定量PCR     
Abstract: [Purpose] In this study, the preliminary study on the glycosyltransferase gene OrGT1(t) in wild rice was carried out, which laid a solid foundation for the further exploration of the synthesis and function of xyloglucan in monocotyledonous plants.[Method] A glycosyltransferases gene OrGT1(t) was cloned from Oryza rufupogon using homologous cloning methods.[Results] Sequence analysis revealed that the gene has a conservative Glyco-transf-34 domain,belonging to the Glyco-transf-34 gene falimy. Phylogenetic analysis showed that OrGT1 may be a xyloglucan xylosetransferase geneinvolve in xyloglucan synthesis.RT-qPCR analysis indicated that the OrGT1 expressed in all checked organs, including the root,stem,leaf and spike in O.rufupogon.But the transcriptional quantity was different among the organs, and there were the highest expression quantity in the stem and the lowest in the root.[Conclusion] The OrGT1 gene is a high degree of functional conservation in the evolutionary process, suggesting that the OrGT1(t) gene may be a xyloglucanase gene involved in xyloglucan synthesis, the results lay a good foundation for further exploring the function of the OrGT1 gene.
KeywordsOryza rufupogon   glycosyltransferase gene   gene clone   real-time PCR     
Received 2017-03-06;
Fund:国家自然科学基金项目(31560300);云南省重点科技计划项目(2014BB016)。
Corresponding Authors: 徐津(1968-),男,云南曲靖人,博士,高级农艺师,硕士生导师,主要从事水稻分子生物学研究。E-mail:genexu@126.com     Email: genexu@126.com
About author: 罗碧(1989-),女,云南曲靖人,在读硕士研究生,主要从事分子生物学研究。E-mail:395682010@qq.com
引用本文:   
罗碧, 冯洁深, 白和灵, 刘超, 赵锦龙, 谭亚玲, 徐津.普通野生稻(Oryza rufupogon)糖基转移酶基因OrGT1(t)的克隆与表达分析[J]  云南农业大学学报(自然科学), 2017,V32(4): 571-576
LUO Bi, FENG Jieshen, BAI Heling, LIU Chao, ZHAO Jinlong, TAN Yaling, XU Jin.Cloning and Expression Analyses of Glycosyltransferases Gene OrGT1(t) in Oryza rufupogon[J]  Journal of Yunnan Agricultural University, 2017,V32(4): 571-576
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